商家查询包裹的运输轨迹，可以通过以下几种方式实现：

一、使用快递公司官方渠道

官方网站：

商家可以登录快递公司的官方网站，在提供的查询框中输入快递单号，即可查看包裹的实时运输轨迹。这种方式直接、快捷，且信息准确。

官方APP：

顺丰、圆通、中通、申通等主流快递公司都推出了官方APP，商家可以在APP中绑定自己的账号，通过输入快递单号来查询包裹的运输轨迹。这些APP通常还提供了更加丰富的功能，如订单管理、寄件服务等。

二、使用第三方物流查询平台

快递鸟：

快递鸟是一个提供物流监控和商家寄件功能的平台，支持2500家物流公司单号批量查询。商家可以通过快递鸟平台方便地查询和跟踪多个订单的运输轨迹，实现实时监控。

其他第三方平台：

市场上还有许多其他第三方物流查询平台，如TrackingYee等，它们也提供了类似的物流查询服务。商家可以根据自己的需求和偏好选择合适的平台进行查询。

三、联系快递公司客服

如果商家在查询过程中遇到任何问题或无法获取到实时信息，可以直接联系快递公司的客服部门。提供快递单号后，客服人员会帮助商家查询包裹的运输轨迹，并解答相关疑问。